കേരള ക്രൈം ഫയല്‍സ് സീസണ്‍ 2 ആരംഭിക്കുന്നത് തലസ്ഥാനത്തെ പൊലീസ് സ്റ്റേഷനില്‍ നിന്നാണ്. അച്ചടക്ക നടപടിയെ തുടര്‍ന്ന് പൊലീസുകാരെയെല്ലാം സ്ഥലം മാറ്റിയ സ്റ്റേഷന്‍. ആദ്യ ഭാഗത്തിന്റെ അതേ ലോകത്തിലുള്ള, എന്നാല്‍ തീര്‍ത്തും വ്യത്യസ്തമായ പരിസരത്തു നിന്നും കഥ പറഞ്ഞു തുടങ്ങുന്നത് പോലെ. അന്ന് മധ്യ കേരളത്തില്‍ നിന്നും തെക്കന്‍ കേരളത്തിലേക്ക് പോയത് പോലെ, ഇത്തവണ തിരിച്ച് തിരുവനന്തപുരത്തു നിന്നും വടക്കോട്ടാണ് സീരീസ് സഞ്ചരിക്കുന്നത്.